Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q499Y3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q499Y3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q499Y3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q499Y3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q499Y3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q499Y3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q499Y3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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