Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms