Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms