Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms