Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms