Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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