Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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