Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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