Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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LAMA3Q16787 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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LAMA3Q16787 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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