Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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