Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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