Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms