Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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LY6EQ16553 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LY6EQ16553 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LY6EQ16553 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LY6EQ16553 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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LY6EQ16553 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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LY6EQ16553 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LY6EQ16553 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LY6EQ16553 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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LY6EQ16553 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LY6EQ16553 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LY6EQ16553 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LY6EQ16553 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LY6EQ16553 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LY6EQ16553 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LY6EQ16553 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LY6EQ16553 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LY6EQ16553 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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