Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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SNAPC1Q16533 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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SNAPC1Q16533 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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SNAPC1Q16533 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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SNAPC1Q16533 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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SNAPC1Q16533 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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SNAPC1Q16533 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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