Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA4Q16363 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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