Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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