Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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