Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCF4Q15080 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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