Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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HERPUD1Q15011 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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HERPUD1Q15011 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HERPUD1Q15011 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HERPUD1Q15011 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HERPUD1Q15011 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HERPUD1Q15011 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HERPUD1Q15011 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HERPUD1Q15011 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HERPUD1Q15011 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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HERPUD1Q15011 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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HERPUD1Q15011 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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HERPUD1Q15011 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
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HERPUD1Q15011 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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