Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms