Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOFQ13790 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOFQ13790 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
APOFQ13790 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
APOFQ13790 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
APOFQ13790 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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APOFQ13790 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOFQ13790 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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APOFQ13790 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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APOFQ13790 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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APOFQ13790 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOFQ13790 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOFQ13790 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOFQ13790 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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