Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms