Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms