Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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