Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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