Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATMQ13315 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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