Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CHAF1BQ13112 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CHAF1BQ13112 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CHAF1BQ13112 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CHAF1BQ13112 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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CHAF1BQ13112 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CHAF1BQ13112 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CHAF1BQ13112 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CHAF1BQ13112 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CHAF1BQ13112 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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