Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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