Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC20Q12834 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms