Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms