Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms