Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KRTAP1-1Q07627 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms