Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms