Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms