Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms