Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms