Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTN2Q02246 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms