Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms