Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNAQ00169 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms