Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms