Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA52P62987 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA52P62987 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms