Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms