Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms