Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PGGT1BP53609 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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PGGT1BP53609 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PGGT1BP53609 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PGGT1BP53609 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PGGT1BP53609 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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