Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms