Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL1P40616 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL1P40616 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms