Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETFBP38117 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETFBP38117 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ETFBP38117 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ETFBP38117 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ETFBP38117 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ETFBP38117 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ETFBP38117 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms