Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
OTX2P32243 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTX2P32243 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms