Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA5P31644 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms