Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms